Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VhlP40338 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VhlP40338 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VhlP40338 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VhlP40338 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VhlP40338 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VhlP40338 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VhlP40338 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VhlP40338 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VhlP40338 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VhlP40338 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VhlP40338 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VhlP40338 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VhlP40338 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VhlP40338 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VhlP40338 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VhlP40338 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VhlP40338 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VhlP40338 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VhlP40338 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VhlP40338 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VhlP40338 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VhlP40338 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VhlP40338 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VhlP40338 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VhlP40338 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VhlP40338 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VhlP40338 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VhlP40338 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VhlP40338 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VhlP40338 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VhlP40338 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VhlP40338 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VhlP40338 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VhlP40338 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VhlP40338 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VhlP40338 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VhlP40338 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VhlP40338 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VhlP40338 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VhlP40338 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VhlP40338 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VhlP40338 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VhlP40338 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VhlP40338 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VhlP40338 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VhlP40338 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VhlP40338 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VhlP40338 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VhlP40338 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VhlP40338 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VhlP40338 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VhlP40338 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VhlP40338 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VhlP40338 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VhlP40338 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VhlP40338 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VhlP40338 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VhlP40338 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VhlP40338 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VhlP40338 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VhlP40338 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VhlP40338 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VhlP40338 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VhlP40338 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VhlP40338 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VhlP40338 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VhlP40338 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VhlP40338 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VhlP40338 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VhlP40338 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VhlP40338 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VhlP40338 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VhlP40338 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VhlP40338 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VhlP40338 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VhlP40338 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VhlP40338 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VhlP40338 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VhlP40338 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VhlP40338 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VhlP40338 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VhlP40338 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VhlP40338 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VhlP40338 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VhlP40338 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VhlP40338 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VhlP40338 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VhlP40338 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VhlP40338 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VhlP40338 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VhlP40338 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VhlP40338 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VhlP40338 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VhlP40338 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VhlP40338 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VhlP40338 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VhlP40338 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
VhlP40338 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VhlP40338 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms