Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ThpoP40226 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ThpoP40226 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ThpoP40226 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ThpoP40226 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ThpoP40226 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ThpoP40226 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ThpoP40226 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ThpoP40226 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ThpoP40226 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ThpoP40226 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ThpoP40226 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ThpoP40226 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ThpoP40226 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ThpoP40226 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ThpoP40226 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ThpoP40226 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ThpoP40226 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ThpoP40226 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ThpoP40226 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms