Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Chd1P40201 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Chd1P40201 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Chd1P40201 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Chd1P40201 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Chd1P40201 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Chd1P40201 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Chd1P40201 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Chd1P40201 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Chd1P40201 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Chd1P40201 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Chd1P40201 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Chd1P40201 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Chd1P40201 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Chd1P40201 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Chd1P40201 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Chd1P40201 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Chd1P40201 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Chd1P40201 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Chd1P40201 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Chd1P40201 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Chd1P40201 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Chd1P40201 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Chd1P40201 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Chd1P40201 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Chd1P40201 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Chd1P40201 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Chd1P40201 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Chd1P40201 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Chd1P40201 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Chd1P40201 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Chd1P40201 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Chd1P40201 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Chd1P40201 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Chd1P40201 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Chd1P40201 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Chd1P40201 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Chd1P40201 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Chd1P40201 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Chd1P40201 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Chd1P40201 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Chd1P40201 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Chd1P40201 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Chd1P40201 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Chd1P40201 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Chd1P40201 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Chd1P40201 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Chd1P40201 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Chd1P40201 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Chd1P40201 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Chd1P40201 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Chd1P40201 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms