Protein–RNA interactions for Protein: P35917

Flt4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt4P35917 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Flt4P35917 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Flt4P35917 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Flt4P35917 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Flt4P35917 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Flt4P35917 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Flt4P35917 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Flt4P35917 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Flt4P35917 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Flt4P35917 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Flt4P35917 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Flt4P35917 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Flt4P35917 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Flt4P35917 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Flt4P35917 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Flt4P35917 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Flt4P35917 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Flt4P35917 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Flt4P35917 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Flt4P35917 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Flt4P35917 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Flt4P35917 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Flt4P35917 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Flt4P35917 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Flt4P35917 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Flt4P35917 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Flt4P35917 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Flt4P35917 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Flt4P35917 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Flt4P35917 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Flt4P35917 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Flt4P35917 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Flt4P35917 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Flt4P35917 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Flt4P35917 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Flt4P35917 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Flt4P35917 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Flt4P35917 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Flt4P35917 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Flt4P35917 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Flt4P35917 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Flt4P35917 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Flt4P35917 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Flt4P35917 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Flt4P35917 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Flt4P35917 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Flt4P35917 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Flt4P35917 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Flt4P35917 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms