Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PtprkP35822 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PtprkP35822 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PtprkP35822 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PtprkP35822 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PtprkP35822 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PtprkP35822 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PtprkP35822 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PtprkP35822 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PtprkP35822 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PtprkP35822 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PtprkP35822 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PtprkP35822 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
PtprkP35822 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PtprkP35822 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PtprkP35822 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PtprkP35822 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms