Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX11P35716 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX11P35716 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX11P35716 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX11P35716 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX11P35716 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX11P35716 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX11P35716 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX11P35716 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX11P35716 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX11P35716 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX11P35716 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX11P35716 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX11P35716 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX11P35716 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX11P35716 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX11P35716 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX11P35716 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX11P35716 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX11P35716 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX11P35716 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX11P35716 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX11P35716 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX11P35716 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX11P35716 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX11P35716 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX11P35716 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX11P35716 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX11P35716 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX11P35716 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX11P35716 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX11P35716 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX11P35716 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX11P35716 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX11P35716 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX11P35716 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX11P35716 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX11P35716 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX11P35716 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX11P35716 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX11P35716 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX11P35716 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX11P35716 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX11P35716 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX11P35716 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX11P35716 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX11P35716 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX11P35716 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX11P35716 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX11P35716 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX11P35716 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX11P35716 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX11P35716 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX11P35716 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX11P35716 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX11P35716 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX11P35716 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX11P35716 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX11P35716 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX11P35716 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX11P35716 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX11P35716 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX11P35716 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX11P35716 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX11P35716 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX11P35716 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX11P35716 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX11P35716 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX11P35716 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX11P35716 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX11P35716 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX11P35716 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX11P35716 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX11P35716 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX11P35716 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX11P35716 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX11P35716 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX11P35716 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX11P35716 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX11P35716 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX11P35716 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX11P35716 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX11P35716 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX11P35716 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX11P35716 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX11P35716 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX11P35716 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX11P35716 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX11P35716 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX11P35716 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX11P35716 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX11P35716 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX11P35716 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX11P35716 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX11P35716 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX11P35716 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX11P35716 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX11P35716 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX11P35716 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX11P35716 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms