Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATP7BP35670 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ATP7BP35670 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms