Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN7P35236 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN7P35236 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms