Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ptpn11P35235 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptpn11P35235 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn11P35235 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms