Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoc3P33622 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc3P33622 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms