Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CPS1P31327 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CPS1P31327 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CPS1P31327 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CPS1P31327 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CPS1P31327 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CPS1P31327 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CPS1P31327 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CPS1P31327 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CPS1P31327 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CPS1P31327 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CPS1P31327 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CPS1P31327 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CPS1P31327 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CPS1P31327 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CPS1P31327 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CPS1P31327 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CPS1P31327 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CPS1P31327 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CPS1P31327 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CPS1P31327 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CPS1P31327 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CPS1P31327 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CPS1P31327 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CPS1P31327 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CPS1P31327 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CPS1P31327 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CPS1P31327 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CPS1P31327 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CPS1P31327 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CPS1P31327 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CPS1P31327 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CPS1P31327 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CPS1P31327 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CPS1P31327 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CPS1P31327 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CPS1P31327 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CPS1P31327 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CPS1P31327 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CPS1P31327 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CPS1P31327 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CPS1P31327 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CPS1P31327 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CPS1P31327 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CPS1P31327 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CPS1P31327 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CPS1P31327 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CPS1P31327 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CPS1P31327 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CPS1P31327 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CPS1P31327 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
CPS1P31327 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CPS1P31327 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CPS1P31327 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CPS1P31327 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CPS1P31327 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CPS1P31327 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CPS1P31327 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CPS1P31327 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CPS1P31327 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CPS1P31327 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CPS1P31327 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CPS1P31327 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CPS1P31327 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CPS1P31327 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CPS1P31327 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CPS1P31327 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CPS1P31327 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CPS1P31327 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CPS1P31327 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CPS1P31327 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CPS1P31327 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
CPS1P31327 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CPS1P31327 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CPS1P31327 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CPS1P31327 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CPS1P31327 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CPS1P31327 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CPS1P31327 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CPS1P31327 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CPS1P31327 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CPS1P31327 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CPS1P31327 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CPS1P31327 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CPS1P31327 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CPS1P31327 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CPS1P31327 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CPS1P31327 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CPS1P31327 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CPS1P31327 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CPS1P31327 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CPS1P31327 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CPS1P31327 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CPS1P31327 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CPS1P31327 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CPS1P31327 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CPS1P31327 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CPS1P31327 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CPS1P31327 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CPS1P31327 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms