Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa10P31310 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa10P31310 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxa10P31310 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa10P31310 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms