Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC13P31276 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms