Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnd1P30999 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctnnd1P30999 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms