Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msr1P30204 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msr1P30204 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msr1P30204 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msr1P30204 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msr1P30204 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msr1P30204 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msr1P30204 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Msr1P30204 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Msr1P30204 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msr1P30204 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msr1P30204 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.7 ms