Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDX6P30041 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDX6P30041 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms