Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VtnP29788 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
VtnP29788 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VtnP29788 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VtnP29788 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VtnP29788 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VtnP29788 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VtnP29788 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VtnP29788 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VtnP29788 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VtnP29788 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VtnP29788 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VtnP29788 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VtnP29788 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VtnP29788 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VtnP29788 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VtnP29788 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VtnP29788 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VtnP29788 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VtnP29788 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VtnP29788 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VtnP29788 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VtnP29788 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VtnP29788 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
VtnP29788 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VtnP29788 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VtnP29788 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
VtnP29788 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VtnP29788 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VtnP29788 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VtnP29788 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VtnP29788 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VtnP29788 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VtnP29788 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VtnP29788 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VtnP29788 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VtnP29788 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VtnP29788 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VtnP29788 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
VtnP29788 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VtnP29788 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VtnP29788 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VtnP29788 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VtnP29788 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VtnP29788 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VtnP29788 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VtnP29788 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VtnP29788 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VtnP29788 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VtnP29788 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VtnP29788 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VtnP29788 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VtnP29788 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VtnP29788 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VtnP29788 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VtnP29788 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VtnP29788 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VtnP29788 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VtnP29788 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VtnP29788 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VtnP29788 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VtnP29788 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VtnP29788 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VtnP29788 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VtnP29788 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VtnP29788 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VtnP29788 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VtnP29788 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VtnP29788 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VtnP29788 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VtnP29788 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VtnP29788 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VtnP29788 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VtnP29788 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VtnP29788 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VtnP29788 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VtnP29788 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VtnP29788 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VtnP29788 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VtnP29788 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VtnP29788 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VtnP29788 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VtnP29788 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VtnP29788 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VtnP29788 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VtnP29788 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VtnP29788 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VtnP29788 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VtnP29788 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VtnP29788 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VtnP29788 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VtnP29788 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VtnP29788 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VtnP29788 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VtnP29788 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VtnP29788 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VtnP29788 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VtnP29788 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VtnP29788 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VtnP29788 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms