Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Casp1P29452 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Casp1P29452 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp1P29452 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casp1P29452 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casp1P29452 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casp1P29452 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp1P29452 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp1P29452 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp1P29452 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casp1P29452 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp1P29452 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp1P29452 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casp1P29452 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Casp1P29452 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Casp1P29452 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms