Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mmp3P28862 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mmp3P28862 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms