Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BgnP28653 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BgnP28653 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BgnP28653 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BgnP28653 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BgnP28653 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BgnP28653 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BgnP28653 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BgnP28653 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BgnP28653 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BgnP28653 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BgnP28653 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BgnP28653 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BgnP28653 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BgnP28653 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BgnP28653 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BgnP28653 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BgnP28653 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BgnP28653 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BgnP28653 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BgnP28653 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BgnP28653 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BgnP28653 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BgnP28653 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BgnP28653 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BgnP28653 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BgnP28653 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BgnP28653 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BgnP28653 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BgnP28653 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BgnP28653 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BgnP28653 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BgnP28653 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BgnP28653 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BgnP28653 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BgnP28653 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BgnP28653 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BgnP28653 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BgnP28653 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BgnP28653 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BgnP28653 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BgnP28653 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BgnP28653 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BgnP28653 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BgnP28653 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BgnP28653 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BgnP28653 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BgnP28653 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BgnP28653 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BgnP28653 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BgnP28653 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BgnP28653 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BgnP28653 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BgnP28653 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BgnP28653 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BgnP28653 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BgnP28653 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BgnP28653 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BgnP28653 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BgnP28653 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BgnP28653 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BgnP28653 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BgnP28653 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BgnP28653 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BgnP28653 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BgnP28653 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BgnP28653 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BgnP28653 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BgnP28653 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BgnP28653 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BgnP28653 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BgnP28653 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BgnP28653 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BgnP28653 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BgnP28653 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BgnP28653 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BgnP28653 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BgnP28653 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BgnP28653 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BgnP28653 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BgnP28653 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BgnP28653 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BgnP28653 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BgnP28653 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BgnP28653 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BgnP28653 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BgnP28653 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BgnP28653 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BgnP28653 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BgnP28653 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BgnP28653 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BgnP28653 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BgnP28653 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BgnP28653 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BgnP28653 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BgnP28653 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BgnP28653 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BgnP28653 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BgnP28653 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BgnP28653 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms