Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRR2P28476 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR2P28476 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRR2P28476 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms