Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa2P28309 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa2P28309 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa2P28309 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa2P28309 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa2P28309 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa2P28309 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa2P28309 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa2P28309 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa2P28309 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa2P28309 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa2P28309 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa2P28309 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms