Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmb9P28076 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb9P28076 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb9P28076 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psmb9P28076 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms