Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLA-DMAP28067 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-DMAP28067 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms