Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD27P26842 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD27P26842 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD27P26842 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD27P26842 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD27P26842 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD27P26842 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD27P26842 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD27P26842 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD27P26842 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD27P26842 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD27P26842 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD27P26842 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD27P26842 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD27P26842 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD27P26842 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD27P26842 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD27P26842 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD27P26842 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CD27P26842 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD27P26842 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD27P26842 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD27P26842 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD27P26842 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD27P26842 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD27P26842 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD27P26842 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD27P26842 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD27P26842 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD27P26842 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD27P26842 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD27P26842 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD27P26842 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD27P26842 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD27P26842 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD27P26842 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD27P26842 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD27P26842 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CD27P26842 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD27P26842 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD27P26842 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD27P26842 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CD27P26842 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD27P26842 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD27P26842 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CD27P26842 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CD27P26842 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD27P26842 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD27P26842 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD27P26842 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD27P26842 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD27P26842 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD27P26842 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD27P26842 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD27P26842 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD27P26842 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD27P26842 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD27P26842 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CD27P26842 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD27P26842 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD27P26842 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD27P26842 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD27P26842 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD27P26842 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD27P26842 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD27P26842 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD27P26842 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD27P26842 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD27P26842 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD27P26842 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD27P26842 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD27P26842 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD27P26842 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD27P26842 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD27P26842 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD27P26842 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD27P26842 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD27P26842 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD27P26842 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD27P26842 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD27P26842 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD27P26842 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD27P26842 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CD27P26842 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD27P26842 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD27P26842 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD27P26842 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD27P26842 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD27P26842 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD27P26842 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD27P26842 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD27P26842 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD27P26842 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD27P26842 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD27P26842 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD27P26842 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD27P26842 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD27P26842 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD27P26842 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD27P26842 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms