Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmo2P25801 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmo2P25801 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms