Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd1P25322 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccnd1P25322 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccnd1P25322 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms