Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cdk11bP24788 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cdk11bP24788 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cdk11bP24788 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cdk11bP24788 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cdk11bP24788 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Cdk11bP24788 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cdk11bP24788 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cdk11bP24788 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cdk11bP24788 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Cdk11bP24788 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cdk11bP24788 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cdk11bP24788 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cdk11bP24788 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cdk11bP24788 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms