Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc6P23475 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Xrcc6P23475 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Xrcc6P23475 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrcc6P23475 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms