Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRDP23468 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRDP23468 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRDP23468 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
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