Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
S100A1P23297 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
S100A1P23297 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
S100A1P23297 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
S100A1P23297 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
S100A1P23297 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
S100A1P23297 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
S100A1P23297 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
S100A1P23297 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
S100A1P23297 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
S100A1P23297 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
S100A1P23297 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
S100A1P23297 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
S100A1P23297 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
S100A1P23297 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
S100A1P23297 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
S100A1P23297 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
S100A1P23297 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
S100A1P23297 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
S100A1P23297 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
S100A1P23297 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
S100A1P23297 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
S100A1P23297 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
S100A1P23297 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
S100A1P23297 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
S100A1P23297 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
S100A1P23297 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
S100A1P23297 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
S100A1P23297 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
S100A1P23297 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
S100A1P23297 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
S100A1P23297 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
S100A1P23297 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
S100A1P23297 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
S100A1P23297 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
S100A1P23297 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
S100A1P23297 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
S100A1P23297 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
S100A1P23297 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
S100A1P23297 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
S100A1P23297 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
S100A1P23297 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
S100A1P23297 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
S100A1P23297 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
S100A1P23297 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
S100A1P23297 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
S100A1P23297 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
S100A1P23297 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
S100A1P23297 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
S100A1P23297 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
S100A1P23297 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
S100A1P23297 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
S100A1P23297 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
S100A1P23297 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
S100A1P23297 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
S100A1P23297 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
S100A1P23297 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
S100A1P23297 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
S100A1P23297 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
S100A1P23297 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
S100A1P23297 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
S100A1P23297 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
S100A1P23297 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
S100A1P23297 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
S100A1P23297 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
S100A1P23297 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
S100A1P23297 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
S100A1P23297 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
S100A1P23297 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
S100A1P23297 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
S100A1P23297 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
S100A1P23297 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
S100A1P23297 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
S100A1P23297 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
S100A1P23297 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
S100A1P23297 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
S100A1P23297 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
S100A1P23297 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
S100A1P23297 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
S100A1P23297 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
S100A1P23297 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
S100A1P23297 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
S100A1P23297 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
S100A1P23297 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
S100A1P23297 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
S100A1P23297 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
S100A1P23297 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
S100A1P23297 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
S100A1P23297 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
S100A1P23297 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
S100A1P23297 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
S100A1P23297 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
S100A1P23297 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
S100A1P23297 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
S100A1P23297 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
S100A1P23297 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
S100A1P23297 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
S100A1P23297 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
S100A1P23297 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
S100A1P23297 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms