Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEA1P23193 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA1P23193 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEA1P23193 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms