Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmbsP22907 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmbsP22907 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HmbsP22907 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HmbsP22907 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmbsP22907 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmbsP22907 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmbsP22907 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HmbsP22907 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmbsP22907 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmbsP22907 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmbsP22907 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms