Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prim1P20664 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prim1P20664 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prim1P20664 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prim1P20664 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prim1P20664 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Prim1P20664 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prim1P20664 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Prim1P20664 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prim1P20664 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prim1P20664 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prim1P20664 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Prim1P20664 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prim1P20664 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prim1P20664 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prim1P20664 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prim1P20664 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prim1P20664 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prim1P20664 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prim1P20664 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prim1P20664 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms