Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PVALBP20472 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PVALBP20472 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PVALBP20472 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PVALBP20472 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PVALBP20472 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PVALBP20472 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PVALBP20472 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PVALBP20472 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PVALBP20472 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PVALBP20472 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PVALBP20472 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PVALBP20472 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PVALBP20472 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PVALBP20472 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PVALBP20472 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PVALBP20472 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PVALBP20472 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PVALBP20472 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PVALBP20472 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PVALBP20472 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PVALBP20472 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PVALBP20472 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PVALBP20472 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PVALBP20472 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PVALBP20472 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PVALBP20472 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PVALBP20472 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PVALBP20472 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PVALBP20472 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PVALBP20472 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PVALBP20472 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PVALBP20472 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PVALBP20472 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PVALBP20472 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PVALBP20472 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PVALBP20472 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PVALBP20472 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PVALBP20472 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PVALBP20472 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PVALBP20472 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PVALBP20472 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PVALBP20472 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PVALBP20472 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PVALBP20472 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PVALBP20472 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PVALBP20472 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PVALBP20472 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PVALBP20472 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PVALBP20472 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PVALBP20472 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PVALBP20472 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PVALBP20472 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PVALBP20472 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PVALBP20472 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PVALBP20472 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PVALBP20472 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PVALBP20472 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PVALBP20472 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PVALBP20472 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PVALBP20472 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PVALBP20472 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PVALBP20472 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PVALBP20472 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PVALBP20472 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PVALBP20472 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PVALBP20472 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PVALBP20472 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PVALBP20472 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PVALBP20472 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PVALBP20472 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PVALBP20472 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PVALBP20472 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PVALBP20472 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PVALBP20472 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PVALBP20472 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PVALBP20472 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PVALBP20472 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PVALBP20472 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PVALBP20472 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PVALBP20472 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PVALBP20472 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PVALBP20472 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PVALBP20472 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PVALBP20472 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PVALBP20472 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PVALBP20472 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PVALBP20472 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PVALBP20472 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PVALBP20472 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PVALBP20472 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PVALBP20472 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms