Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3BP20337 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3BP20337 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3BP20337 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3BP20337 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3BP20337 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3BP20337 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3BP20337 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms