Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phka1P18826 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phka1P18826 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phka1P18826 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phka1P18826 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phka1P18826 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phka1P18826 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phka1P18826 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phka1P18826 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phka1P18826 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phka1P18826 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phka1P18826 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phka1P18826 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Phka1P18826 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phka1P18826 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phka1P18826 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms