Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGAM1P18669 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms