Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRAP18433 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRAP18433 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRAP18433 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRAP18433 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
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