Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEBPBP17676 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEBPBP17676 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEBPBP17676 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEBPBP17676 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEBPBP17676 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEBPBP17676 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEBPBP17676 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEBPBP17676 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms