Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ass1P16460 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ass1P16460 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ass1P16460 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ass1P16460 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ass1P16460 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ass1P16460 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ass1P16460 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ass1P16460 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ass1P16460 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ass1P16460 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ass1P16460 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ass1P16460 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ass1P16460 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ass1P16460 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ass1P16460 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms