Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF3P15923 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF3P15923 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF3P15923 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF3P15923 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF3P15923 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF3P15923 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF3P15923 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF3P15923 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF3P15923 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TCF3P15923 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCF3P15923 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCF3P15923 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCF3P15923 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCF3P15923 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF3P15923 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF3P15923 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF3P15923 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF3P15923 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF3P15923 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF3P15923 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF3P15923 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF3P15923 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF3P15923 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF3P15923 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF3P15923 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF3P15923 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF3P15923 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF3P15923 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF3P15923 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF3P15923 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF3P15923 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF3P15923 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF3P15923 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF3P15923 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF3P15923 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF3P15923 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF3P15923 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF3P15923 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF3P15923 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF3P15923 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF3P15923 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF3P15923 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF3P15923 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF3P15923 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF3P15923 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF3P15923 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF3P15923 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCF3P15923 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF3P15923 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF3P15923 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF3P15923 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF3P15923 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF3P15923 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF3P15923 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF3P15923 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF3P15923 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF3P15923 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF3P15923 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF3P15923 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF3P15923 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF3P15923 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF3P15923 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF3P15923 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF3P15923 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF3P15923 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF3P15923 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF3P15923 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF3P15923 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF3P15923 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF3P15923 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF3P15923 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF3P15923 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF3P15923 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF3P15923 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF3P15923 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF3P15923 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF3P15923 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF3P15923 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF3P15923 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF3P15923 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF3P15923 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF3P15923 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF3P15923 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF3P15923 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF3P15923 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF3P15923 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF3P15923 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF3P15923 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF3P15923 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF3P15923 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF3P15923 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF3P15923 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF3P15923 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF3P15923 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TCF3P15923 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF3P15923 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF3P15923 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF3P15923 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF3P15923 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms