Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrgnP13609 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrgnP13609 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrgnP13609 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrgnP13609 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SrgnP13609 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrgnP13609 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SrgnP13609 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrgnP13609 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrgnP13609 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrgnP13609 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrgnP13609 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrgnP13609 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrgnP13609 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SrgnP13609 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrgnP13609 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrgnP13609 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms