Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD1P11586 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFD1P11586 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTHFD1P11586 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFD1P11586 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms