Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamp1P11438 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lamp1P11438 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamp1P11438 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lamp1P11438 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms