Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRM1P11229 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRM1P11229 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRM1P11229 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRM1P11229 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms