Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Tnp1P10856 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms