Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CHGAP10645 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHGAP10645 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHGAP10645 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHGAP10645 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CHGAP10645 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHGAP10645 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CHGAP10645 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CHGAP10645 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CHGAP10645 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CHGAP10645 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHGAP10645 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHGAP10645 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHGAP10645 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHGAP10645 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHGAP10645 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHGAP10645 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHGAP10645 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHGAP10645 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CHGAP10645 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHGAP10645 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CHGAP10645 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHGAP10645 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHGAP10645 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
CHGAP10645 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHGAP10645 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHGAP10645 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHGAP10645 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHGAP10645 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHGAP10645 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHGAP10645 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHGAP10645 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHGAP10645 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHGAP10645 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHGAP10645 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHGAP10645 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHGAP10645 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHGAP10645 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHGAP10645 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHGAP10645 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHGAP10645 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHGAP10645 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHGAP10645 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CHGAP10645 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHGAP10645 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHGAP10645 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHGAP10645 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHGAP10645 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHGAP10645 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHGAP10645 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHGAP10645 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHGAP10645 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHGAP10645 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHGAP10645 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHGAP10645 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHGAP10645 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHGAP10645 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHGAP10645 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHGAP10645 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHGAP10645 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHGAP10645 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHGAP10645 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHGAP10645 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CHGAP10645 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHGAP10645 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHGAP10645 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHGAP10645 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHGAP10645 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CHGAP10645 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHGAP10645 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHGAP10645 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHGAP10645 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHGAP10645 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHGAP10645 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHGAP10645 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHGAP10645 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHGAP10645 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHGAP10645 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHGAP10645 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHGAP10645 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHGAP10645 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHGAP10645 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHGAP10645 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHGAP10645 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CHGAP10645 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHGAP10645 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHGAP10645 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms