Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM49P0CI25 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM49P0CI25 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM49P0CI25 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms