Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM228BP0C875 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM228BP0C875 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM228BP0C875 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.7 ms